籃式過濾器的長周期運行關鍵取決于濾芯不破損。濾芯是由不銹鋼板沖孔而成，因而其所能承受的壓力就受到限制，尤其是反向(從外向內)壓力更不能超高。沖洗壓差如果超過0.5MPa。就有壓破濾芯的危險。為保護濾芯，在開工初期進油漿前應用回煉油進行充分預熱。預熱過程中要注意避免偏流，用手閥卡量，確保每臺籃式過濾器都能預熱充分。必須避免在殼體壓力大于0.45MPa的情況下打開卸料閥進行沖洗。如果進出籃式過濾器的閥門出現泄露，濾餅罐液位在反沖洗時明顯上升，也有可能造成沖洗前殼體壓力大于0.5MPa。如現場發現殼內壓力過高，應先打開回煉油出口閥將壓力降到安全值，再檢查分析殼內壓力突然升高的原因。

籃式過濾器濾芯長時間使用會有部分雜質堵塞濾孔，影響過濾效果。目前國內已能夠對濾芯進行超聲波清洗，使濾芯恢復到原來狀態。某公司研究出以溶劑除油、烘烤除垢、催化轉性、酸洗和超聲波清洗相結合的清洗工藝和藥劑，應用效果很好。在籃式過濾器檢修期間將濾芯運送至大連進行清洗，過濾效果恢復很好。

在籃式過濾器濾芯內含有較多的油漿固體物，過濾器運行期間，部分雜質會沉積在過濾網底部，造成籃式出口堵塞，輸送油品的管線也會出現堵塞現象。在籃式過濾器筒體底部接了一條清洗用柴油線，定期對籃式過濾器進行出口沖洗，解決了籃式過濾器堵罐問題。